I progetti devono rientrare nell'ambito di un singolo Obiettivo Specifico (OS) del Programma e rispondere alle sfide territoriali e tematiche identificate nel Programma Operativo. Le attività proposte devono essere coerenti con le tipologie di azione del Programma come specificato per ogni OS e devono contribuire tutte al raggiungimento dell'obiettivo generale del progetto.
A tal fine, i progetti devono soddisfare in modo sostanziale gli indicatori di realizzazione e di risultato previsti nell'ambito dell'OS selezionato nella candidatura.
Si ricorda inoltre che il Programma Operativo individua priorità territoriali e tematiche per ogni OS, di cui si deve tenere conto.
Obiettivi specifici:

• Cogliere i vantaggi della digitalizzazione a favore dei cittadini, delle imprese, delle organizzazioni di ricerca e dei governi
• Sviluppare competenze in specializzazione intelligente, transizione industriale e imprenditorialità
• Promuovere l'energia rinnovabile in conformità con la direttiva (UE) 2018/2001, compresi i criteri di sostenibilità in essa stabiliti
• Promuovere l'adattamento al cambiamento climatico, la riduzione del rischio di disastri e la resilienza, tenendo conto degli approcci basati sugli ecosistemi
• Migliorare la protezione e la conservazione della natura e della biodiversità e rafforzare le infrastrutture verdi, soprattutto nelle aree urbane, e ridurre tutte le forme di inquinamento
• Promuovere la mobilità urbana multimodale sostenibile come parte della transizione verso un'economia a zero emissioni di carbonio
• Garantire la parità di accesso all'assistenza sanitaria e promuovere la resilienza dei sistemi sanitari, compresa l'assistenza sanitaria primaria, e promuovere il passaggio dall'assistenza istituzionale a quella familiare o comunitaria
• Una migliore governance di cooperazione.

Nell’ambito del Programma ALCOTRA i progetti sono presentati da un insieme di soggetti che compongono il partenariato. È necessario che nel partenariato siano presenti almeno un soggetto italiano e uno francese.
Un'entità giuridica transfrontaliera o un GECT può essere l'unico partner di un progetto a condizione che i suoi membri implichino la partecipazione di almeno un partner per paese.